Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZfaP23607 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZfaP23607 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZfaP23607 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZfaP23607 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZfaP23607 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZfaP23607 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZfaP23607 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZfaP23607 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZfaP23607 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZfaP23607 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZfaP23607 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZfaP23607 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZfaP23607 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZfaP23607 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZfaP23607 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms