Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RarbP22605 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RarbP22605 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RarbP22605 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RarbP22605 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RarbP22605 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RarbP22605 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RarbP22605 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RarbP22605 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RarbP22605 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RarbP22605 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RarbP22605 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RarbP22605 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RarbP22605 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RarbP22605 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RarbP22605 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RarbP22605 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RarbP22605 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RarbP22605 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RarbP22605 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RarbP22605 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RarbP22605 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RarbP22605 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RarbP22605 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RarbP22605 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RarbP22605 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RarbP22605 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RarbP22605 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RarbP22605 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RarbP22605 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RarbP22605 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RarbP22605 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RarbP22605 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RarbP22605 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RarbP22605 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RarbP22605 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RarbP22605 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RarbP22605 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RarbP22605 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RarbP22605 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RarbP22605 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RarbP22605 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RarbP22605 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RarbP22605 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RarbP22605 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RarbP22605 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RarbP22605 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RarbP22605 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RarbP22605 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RarbP22605 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RarbP22605 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RarbP22605 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RarbP22605 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RarbP22605 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RarbP22605 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RarbP22605 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RarbP22605 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RarbP22605 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RarbP22605 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RarbP22605 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RarbP22605 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RarbP22605 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RarbP22605 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RarbP22605 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RarbP22605 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RarbP22605 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RarbP22605 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RarbP22605 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RarbP22605 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RarbP22605 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RarbP22605 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RarbP22605 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RarbP22605 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RarbP22605 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RarbP22605 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RarbP22605 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RarbP22605 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RarbP22605 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RarbP22605 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RarbP22605 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RarbP22605 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RarbP22605 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RarbP22605 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RarbP22605 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RarbP22605 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RarbP22605 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RarbP22605 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RarbP22605 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RarbP22605 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RarbP22605 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RarbP22605 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RarbP22605 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RarbP22605 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RarbP22605 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RarbP22605 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RarbP22605 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RarbP22605 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RarbP22605 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RarbP22605 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RarbP22605 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms