Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PrkcaP20444 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PrkcaP20444 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms