Protein–RNA interactions for Protein: P20352

F3, Tissue factor, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F3P20352 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F3P20352 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
F3P20352 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F3P20352 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
F3P20352 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F3P20352 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F3P20352 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F3P20352 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
F3P20352 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F3P20352 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F3P20352 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
F3P20352 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F3P20352 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F3P20352 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
F3P20352 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
F3P20352 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F3P20352 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F3P20352 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
F3P20352 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F3P20352 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F3P20352 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F3P20352 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F3P20352 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F3P20352 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F3P20352 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F3P20352 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F3P20352 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F3P20352 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F3P20352 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F3P20352 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F3P20352 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
F3P20352 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F3P20352 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F3P20352 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
F3P20352 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F3P20352 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F3P20352 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F3P20352 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
F3P20352 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F3P20352 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F3P20352 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
F3P20352 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
F3P20352 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
F3P20352 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
F3P20352 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
F3P20352 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
F3P20352 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
F3P20352 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
F3P20352 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
F3P20352 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
F3P20352 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
F3P20352 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
F3P20352 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F3P20352 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F3P20352 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F3P20352 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F3P20352 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F3P20352 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F3P20352 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F3P20352 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
F3P20352 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
F3P20352 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
F3P20352 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
F3P20352 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
F3P20352 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
F3P20352 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
F3P20352 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
F3P20352 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
F3P20352 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
F3P20352 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
F3P20352 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F3P20352 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F3P20352 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
F3P20352 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
F3P20352 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
F3P20352 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
F3P20352 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
F3P20352 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F3P20352 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F3P20352 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F3P20352 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
F3P20352 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
F3P20352 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F3P20352 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F3P20352 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F3P20352 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F3P20352 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F3P20352 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F3P20352 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F3P20352 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F3P20352 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F3P20352 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
F3P20352 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
F3P20352 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
F3P20352 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F3P20352 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
F3P20352 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F3P20352 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
F3P20352 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
F3P20352 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms