Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifrd1P19182 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ifrd1P19182 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifrd1P19182 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifrd1P19182 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifrd1P19182 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifrd1P19182 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifrd1P19182 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifrd1P19182 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifrd1P19182 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifrd1P19182 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifrd1P19182 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifrd1P19182 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifrd1P19182 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifrd1P19182 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifrd1P19182 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifrd1P19182 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifrd1P19182 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifrd1P19182 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifrd1P19182 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifrd1P19182 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifrd1P19182 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifrd1P19182 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifrd1P19182 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifrd1P19182 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifrd1P19182 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifrd1P19182 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifrd1P19182 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifrd1P19182 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifrd1P19182 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifrd1P19182 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifrd1P19182 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifrd1P19182 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms