Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rps6ka1P18653 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6ka1P18653 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rps6ka1P18653 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rps6ka1P18653 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms