Protein–RNA interactions for Protein: P16294

F9, Coagulation factor IX, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P16294 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F9P16294 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F9P16294 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
F9P16294 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F9P16294 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F9P16294 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F9P16294 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F9P16294 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F9P16294 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
F9P16294 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F9P16294 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F9P16294 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
F9P16294 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
F9P16294 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F9P16294 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F9P16294 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F9P16294 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
F9P16294 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
F9P16294 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F9P16294 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F9P16294 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22■■□□□ 1.11
F9P16294 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F9P16294 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F9P16294 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
F9P16294 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
F9P16294 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
F9P16294 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
F9P16294 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
F9P16294 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
F9P16294 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
F9P16294 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
F9P16294 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
F9P16294 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
F9P16294 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
F9P16294 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
F9P16294 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
F9P16294 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
F9P16294 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
F9P16294 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
F9P16294 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
F9P16294 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
F9P16294 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F9P16294 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F9P16294 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F9P16294 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F9P16294 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
F9P16294 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F9P16294 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F9P16294 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
F9P16294 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
F9P16294 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
F9P16294 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
F9P16294 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
F9P16294 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
F9P16294 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
F9P16294 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
F9P16294 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
F9P16294 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F9P16294 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
F9P16294 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F9P16294 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F9P16294 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
F9P16294 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
F9P16294 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
F9P16294 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
F9P16294 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
F9P16294 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F9P16294 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F9P16294 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F9P16294 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F9P16294 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
F9P16294 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F9P16294 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F9P16294 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F9P16294 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
F9P16294 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F9P16294 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
F9P16294 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F9P16294 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
F9P16294 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F9P16294 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
F9P16294 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F9P16294 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F9P16294 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F9P16294 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
F9P16294 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
F9P16294 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F9P16294 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
F9P16294 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F9P16294 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F9P16294 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F9P16294 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
F9P16294 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
F9P16294 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
F9P16294 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F9P16294 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F9P16294 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F9P16294 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F9P16294 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
F9P16294 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms