Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rag1P15919 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rag1P15919 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rag1P15919 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rag1P15919 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rag1P15919 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rag1P15919 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rag1P15919 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rag1P15919 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rag1P15919 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rag1P15919 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rag1P15919 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rag1P15919 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rag1P15919 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rag1P15919 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rag1P15919 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rag1P15919 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rag1P15919 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 262.8 ms