Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd44P15379 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd44P15379 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd44P15379 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd44P15379 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd44P15379 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd44P15379 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cd44P15379 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd44P15379 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd44P15379 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd44P15379 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd44P15379 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd44P15379 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd44P15379 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd44P15379 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd44P15379 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd44P15379 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd44P15379 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd44P15379 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd44P15379 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd44P15379 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd44P15379 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd44P15379 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd44P15379 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd44P15379 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd44P15379 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd44P15379 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd44P15379 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd44P15379 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd44P15379 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd44P15379 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd44P15379 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd44P15379 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd44P15379 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd44P15379 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd44P15379 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd44P15379 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd44P15379 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd44P15379 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd44P15379 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd44P15379 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd44P15379 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd44P15379 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd44P15379 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd44P15379 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd44P15379 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cd44P15379 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd44P15379 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd44P15379 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd44P15379 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd44P15379 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd44P15379 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd44P15379 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd44P15379 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd44P15379 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd44P15379 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd44P15379 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd44P15379 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd44P15379 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd44P15379 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd44P15379 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd44P15379 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd44P15379 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd44P15379 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd44P15379 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd44P15379 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd44P15379 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd44P15379 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms