Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FosbP13346 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FosbP13346 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FosbP13346 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FosbP13346 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FosbP13346 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FosbP13346 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FosbP13346 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FosbP13346 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FosbP13346 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FosbP13346 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FosbP13346 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FosbP13346 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FosbP13346 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FosbP13346 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FosbP13346 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FosbP13346 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FosbP13346 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FosbP13346 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FosbP13346 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FosbP13346 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FosbP13346 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FosbP13346 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FosbP13346 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FosbP13346 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FosbP13346 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FosbP13346 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FosbP13346 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FosbP13346 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FosbP13346 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FosbP13346 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FosbP13346 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FosbP13346 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FosbP13346 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FosbP13346 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FosbP13346 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FosbP13346 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FosbP13346 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FosbP13346 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FosbP13346 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FosbP13346 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FosbP13346 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FosbP13346 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FosbP13346 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FosbP13346 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FosbP13346 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FosbP13346 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FosbP13346 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FosbP13346 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FosbP13346 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FosbP13346 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FosbP13346 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FosbP13346 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FosbP13346 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FosbP13346 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FosbP13346 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FosbP13346 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FosbP13346 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FosbP13346 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FosbP13346 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FosbP13346 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FosbP13346 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FosbP13346 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FosbP13346 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FosbP13346 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FosbP13346 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FosbP13346 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FosbP13346 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FosbP13346 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FosbP13346 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FosbP13346 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FosbP13346 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FosbP13346 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FosbP13346 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FosbP13346 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FosbP13346 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FosbP13346 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FosbP13346 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FosbP13346 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FosbP13346 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FosbP13346 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FosbP13346 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FosbP13346 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FosbP13346 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FosbP13346 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FosbP13346 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FosbP13346 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FosbP13346 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FosbP13346 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FosbP13346 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FosbP13346 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FosbP13346 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FosbP13346 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FosbP13346 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FosbP13346 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FosbP13346 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FosbP13346 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FosbP13346 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FosbP13346 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FosbP13346 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms