Protein–RNA interactions for Protein: P13020

Gsn, Gelsolin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GsnP13020 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GsnP13020 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GsnP13020 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GsnP13020 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GsnP13020 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GsnP13020 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GsnP13020 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GsnP13020 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GsnP13020 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GsnP13020 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GsnP13020 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GsnP13020 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GsnP13020 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GsnP13020 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GsnP13020 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GsnP13020 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GsnP13020 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GsnP13020 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GsnP13020 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GsnP13020 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GsnP13020 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GsnP13020 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GsnP13020 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GsnP13020 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GsnP13020 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GsnP13020 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GsnP13020 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GsnP13020 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GsnP13020 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GsnP13020 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GsnP13020 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GsnP13020 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GsnP13020 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GsnP13020 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GsnP13020 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GsnP13020 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GsnP13020 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GsnP13020 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GsnP13020 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GsnP13020 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GsnP13020 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GsnP13020 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GsnP13020 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GsnP13020 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GsnP13020 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GsnP13020 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GsnP13020 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GsnP13020 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GsnP13020 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GsnP13020 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GsnP13020 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GsnP13020 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GsnP13020 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GsnP13020 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GsnP13020 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GsnP13020 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GsnP13020 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GsnP13020 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GsnP13020 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GsnP13020 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GsnP13020 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GsnP13020 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GsnP13020 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GsnP13020 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GsnP13020 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GsnP13020 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GsnP13020 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GsnP13020 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GsnP13020 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GsnP13020 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GsnP13020 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GsnP13020 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GsnP13020 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GsnP13020 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GsnP13020 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GsnP13020 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GsnP13020 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GsnP13020 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GsnP13020 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GsnP13020 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GsnP13020 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GsnP13020 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GsnP13020 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GsnP13020 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GsnP13020 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GsnP13020 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GsnP13020 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GsnP13020 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GsnP13020 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GsnP13020 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GsnP13020 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GsnP13020 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GsnP13020 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GsnP13020 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GsnP13020 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GsnP13020 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GsnP13020 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GsnP13020 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GsnP13020 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GsnP13020 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms