Protein–RNA interactions for Protein: P12961

Scg5, Neuroendocrine protein 7B2, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg5P12961 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scg5P12961 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scg5P12961 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg5P12961 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scg5P12961 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg5P12961 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg5P12961 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scg5P12961 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scg5P12961 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scg5P12961 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scg5P12961 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scg5P12961 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scg5P12961 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scg5P12961 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scg5P12961 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scg5P12961 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scg5P12961 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scg5P12961 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Scg5P12961 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scg5P12961 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scg5P12961 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scg5P12961 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scg5P12961 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Scg5P12961 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scg5P12961 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scg5P12961 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scg5P12961 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scg5P12961 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scg5P12961 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Scg5P12961 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scg5P12961 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scg5P12961 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scg5P12961 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scg5P12961 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Scg5P12961 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scg5P12961 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scg5P12961 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms