Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Parp1P11103 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Parp1P11103 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Parp1P11103 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Parp1P11103 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Parp1P11103 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Parp1P11103 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Parp1P11103 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Parp1P11103 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Parp1P11103 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Parp1P11103 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Parp1P11103 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Parp1P11103 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Parp1P11103 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Parp1P11103 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Parp1P11103 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Parp1P11103 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Parp1P11103 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Parp1P11103 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Parp1P11103 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Parp1P11103 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Parp1P11103 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Parp1P11103 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Parp1P11103 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Parp1P11103 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Parp1P11103 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Parp1P11103 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Parp1P11103 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Parp1P11103 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Parp1P11103 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Parp1P11103 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Parp1P11103 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Parp1P11103 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Parp1P11103 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Parp1P11103 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Parp1P11103 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Parp1P11103 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Parp1P11103 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Parp1P11103 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Parp1P11103 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Parp1P11103 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Parp1P11103 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Parp1P11103 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Parp1P11103 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Parp1P11103 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Parp1P11103 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Parp1P11103 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Parp1P11103 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Parp1P11103 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Parp1P11103 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Parp1P11103 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Parp1P11103 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Parp1P11103 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Parp1P11103 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Parp1P11103 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Parp1P11103 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Parp1P11103 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Parp1P11103 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Parp1P11103 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Parp1P11103 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Parp1P11103 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Parp1P11103 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Parp1P11103 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Parp1P11103 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Parp1P11103 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Parp1P11103 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms