Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prf1P10820 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prf1P10820 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prf1P10820 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prf1P10820 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prf1P10820 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prf1P10820 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prf1P10820 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prf1P10820 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prf1P10820 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prf1P10820 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prf1P10820 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prf1P10820 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prf1P10820 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prf1P10820 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prf1P10820 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prf1P10820 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prf1P10820 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prf1P10820 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Prf1P10820 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prf1P10820 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prf1P10820 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Prf1P10820 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prf1P10820 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prf1P10820 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prf1P10820 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prf1P10820 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prf1P10820 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prf1P10820 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prf1P10820 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prf1P10820 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prf1P10820 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prf1P10820 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prf1P10820 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prf1P10820 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prf1P10820 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prf1P10820 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prf1P10820 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prf1P10820 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prf1P10820 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prf1P10820 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prf1P10820 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prf1P10820 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prf1P10820 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prf1P10820 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prf1P10820 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms