Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cd8bP10300 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cd8bP10300 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd8bP10300 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd8bP10300 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd8bP10300 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd8bP10300 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd8bP10300 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd8bP10300 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd8bP10300 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd8bP10300 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd8bP10300 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd8bP10300 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd8bP10300 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd8bP10300 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms