Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Calm3P0DP28 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Calm3P0DP28 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Calm3P0DP28 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Calm3P0DP28 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Calm3P0DP28 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Calm3P0DP28 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Calm3P0DP28 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Calm3P0DP28 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Calm3P0DP28 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Calm3P0DP28 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Calm3P0DP28 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Calm3P0DP28 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Calm3P0DP28 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Calm3P0DP28 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Calm3P0DP28 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calm3P0DP28 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calm3P0DP28 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calm3P0DP28 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calm3P0DP28 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calm3P0DP28 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calm3P0DP28 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calm3P0DP28 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calm3P0DP28 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calm3P0DP28 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calm3P0DP28 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calm3P0DP28 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calm3P0DP28 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calm3P0DP28 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calm3P0DP28 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Calm3P0DP28 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Calm3P0DP28 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Calm3P0DP28 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Calm3P0DP28 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Calm3P0DP28 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Calm3P0DP28 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Calm3P0DP28 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Calm3P0DP28 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calm3P0DP28 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calm3P0DP28 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calm3P0DP28 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calm3P0DP28 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calm3P0DP28 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calm3P0DP28 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calm3P0DP28 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calm3P0DP28 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calm3P0DP28 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calm3P0DP28 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Calm3P0DP28 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Calm3P0DP28 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Calm3P0DP28 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Calm3P0DP28 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Calm3P0DP28 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Calm3P0DP28 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Calm3P0DP28 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Calm3P0DP28 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Calm3P0DP28 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Calm3P0DP28 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Calm3P0DP28 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Calm3P0DP28 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Calm3P0DP28 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Calm3P0DP28 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Calm3P0DP28 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Calm3P0DP28 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Calm3P0DP28 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms