Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Igsf6P0C6B7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Igsf6P0C6B7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Igsf6P0C6B7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Igsf6P0C6B7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Igsf6P0C6B7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Igsf6P0C6B7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Igsf6P0C6B7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Igsf6P0C6B7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Igsf6P0C6B7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Igsf6P0C6B7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Igsf6P0C6B7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Igsf6P0C6B7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Igsf6P0C6B7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Igsf6P0C6B7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Igsf6P0C6B7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Igsf6P0C6B7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Igsf6P0C6B7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Igsf6P0C6B7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Igsf6P0C6B7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Igsf6P0C6B7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms