Protein–RNA interactions for Protein: P09803

Cdh1, Cadherin-1, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh1P09803 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh1P09803 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh1P09803 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh1P09803 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh1P09803 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh1P09803 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh1P09803 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh1P09803 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh1P09803 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh1P09803 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh1P09803 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh1P09803 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh1P09803 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh1P09803 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh1P09803 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh1P09803 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh1P09803 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh1P09803 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms