Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa9P09631 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa9P09631 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa9P09631 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa9P09631 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa9P09631 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa9P09631 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa9P09631 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa9P09631 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa9P09631 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa9P09631 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa9P09631 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa9P09631 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa9P09631 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa9P09631 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa9P09631 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa9P09631 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa9P09631 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa9P09631 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa9P09631 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa9P09631 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa9P09631 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa9P09631 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa9P09631 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxa9P09631 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa9P09631 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hoxa9P09631 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa9P09631 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa9P09631 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa9P09631 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa9P09631 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa9P09631 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa9P09631 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa9P09631 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa9P09631 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa9P09631 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa9P09631 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa9P09631 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa9P09631 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa9P09631 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa9P09631 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa9P09631 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa9P09631 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa9P09631 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa9P09631 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa9P09631 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa9P09631 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa9P09631 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa9P09631 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa9P09631 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa9P09631 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa9P09631 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa9P09631 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa9P09631 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms