Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxb3P09026 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb3P09026 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxb3P09026 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxb3P09026 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxb3P09026 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxb3P09026 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxb3P09026 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxb3P09026 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxb3P09026 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.8 ms