Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc8P09025 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc8P09025 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc8P09025 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc8P09025 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc8P09025 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc8P09025 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc8P09025 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc8P09025 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc8P09025 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc8P09025 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc8P09025 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc8P09025 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc8P09025 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc8P09025 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc8P09025 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxc8P09025 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxc8P09025 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxc8P09025 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hoxc8P09025 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hoxc8P09025 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxc8P09025 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxc8P09025 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxc8P09025 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxc8P09025 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxc8P09025 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxc8P09025 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxc8P09025 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxc8P09025 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms