Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Col3a1P08121 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Col3a1P08121 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Col3a1P08121 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Col3a1P08121 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Col3a1P08121 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col3a1P08121 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col3a1P08121 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col3a1P08121 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col3a1P08121 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col3a1P08121 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col3a1P08121 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col3a1P08121 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col3a1P08121 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col3a1P08121 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col3a1P08121 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col3a1P08121 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col3a1P08121 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col3a1P08121 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col3a1P08121 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms