Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp1P08042 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp1P08042 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp1P08042 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp1P08042 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp1P08042 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp1P08042 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp1P08042 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp1P08042 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp1P08042 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp1P08042 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp1P08042 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp1P08042 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp1P08042 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp1P08042 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp1P08042 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp1P08042 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp1P08042 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp1P08042 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp1P08042 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp1P08042 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp1P08042 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp1P08042 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp1P08042 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp1P08042 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp1P08042 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp1P08042 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp1P08042 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp1P08042 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp1P08042 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp1P08042 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp1P08042 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp1P08042 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp1P08042 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp1P08042 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp1P08042 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp1P08042 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp1P08042 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp1P08042 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp1P08042 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp1P08042 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp1P08042 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp1P08042 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp1P08042 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp1P08042 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp1P08042 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp1P08042 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfp1P08042 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp1P08042 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp1P08042 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp1P08042 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp1P08042 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp1P08042 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zfp1P08042 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp1P08042 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp1P08042 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms