Protein–RNA interactions for Protein: P06837

Gap43, Neuromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gap43P06837 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gap43P06837 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gap43P06837 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gap43P06837 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gap43P06837 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gap43P06837 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gap43P06837 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gap43P06837 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gap43P06837 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gap43P06837 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gap43P06837 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gap43P06837 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gap43P06837 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gap43P06837 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gap43P06837 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gap43P06837 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gap43P06837 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gap43P06837 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gap43P06837 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gap43P06837 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gap43P06837 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gap43P06837 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gap43P06837 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gap43P06837 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gap43P06837 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gap43P06837 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gap43P06837 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gap43P06837 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gap43P06837 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gap43P06837 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gap43P06837 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gap43P06837 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gap43P06837 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gap43P06837 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Gap43P06837 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gap43P06837 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gap43P06837 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gap43P06837 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gap43P06837 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gap43P06837 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gap43P06837 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gap43P06837 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gap43P06837 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gap43P06837 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gap43P06837 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gap43P06837 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gap43P06837 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gap43P06837 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gap43P06837 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gap43P06837 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gap43P06837 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gap43P06837 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gap43P06837 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gap43P06837 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gap43P06837 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gap43P06837 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gap43P06837 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gap43P06837 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gap43P06837 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms