Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PdgfrbP05622 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PdgfrbP05622 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PdgfrbP05622 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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