Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Eb1P04230 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
H2-Eb1P04230 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Eb1P04230 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Eb1P04230 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-Eb1P04230 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-Eb1P04230 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-Eb1P04230 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-Eb1P04230 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-Eb1P04230 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-Eb1P04230 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Eb1P04230 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Eb1P04230 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-Eb1P04230 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-Eb1P04230 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-Eb1P04230 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-Eb1P04230 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-Eb1P04230 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Eb1P04230 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Eb1P04230 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Eb1P04230 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Eb1P04230 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Eb1P04230 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Eb1P04230 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Eb1P04230 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Eb1P04230 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Eb1P04230 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Eb1P04230 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Eb1P04230 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Eb1P04230 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
H2-Eb1P04230 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-Eb1P04230 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-Eb1P04230 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.8 ms