Protein–RNA interactions for Protein: P01791

Ig heavy chain V region HPCM6, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01791 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01791 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01791 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01791 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01791 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01791 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01791 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01791 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01791 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01791 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01791 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01791 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01791 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01791 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01791 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01791 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01791 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01791 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01791 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01791 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01791 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01791 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01791 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01791 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01791 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01791 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01791 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01791 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01791 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01791 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01791 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01791 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01791 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01791 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01791 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01791 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01791 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01791 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01791 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01791 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01791 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01791 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01791 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01791 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01791 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01791 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01791 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01791 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01791 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01791 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01791 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01791 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01791 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01791 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01791 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01791 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01791 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01791 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01791 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01791 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01791 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01791 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01791 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01791 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01791 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01791 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01791 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01791 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01791 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01791 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01791 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01791 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01791 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01791 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01791 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01791 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01791 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01791 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01791 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01791 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01791 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01791 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01791 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01791 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01791 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01791 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01791 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01791 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01791 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01791 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01791 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01791 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01791 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01791 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01791 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01791 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01791 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01791 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01791 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01791 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms