Protein–RNA interactions for Protein: P01728

Ig lambda-2 chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01728 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01728 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01728 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01728 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
P01728 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
P01728 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01728 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01728 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
P01728 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01728 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01728 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01728 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01728 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01728 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01728 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01728 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
P01728 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01728 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01728 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01728 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01728 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01728 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01728 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01728 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01728 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01728 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01728 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01728 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01728 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01728 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01728 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01728 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01728 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01728 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01728 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01728 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01728 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
P01728 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01728 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01728 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01728 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
P01728 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01728 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
P01728 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01728 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01728 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01728 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01728 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01728 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01728 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01728 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01728 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01728 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01728 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01728 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01728 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01728 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01728 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01728 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01728 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01728 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01728 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01728 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01728 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01728 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01728 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01728 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01728 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01728 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01728 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01728 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01728 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01728 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01728 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01728 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01728 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01728 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01728 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01728 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01728 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01728 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01728 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01728 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01728 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01728 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01728 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01728 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01728 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01728 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01728 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01728 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01728 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01728 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01728 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01728 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01728 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
P01728 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01728 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01728 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01728 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 199.8 ms