Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01644 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01644 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01644 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01644 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01644 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01644 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01644 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P01644 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
P01644 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P01644 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01644 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01644 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01644 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01644 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01644 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01644 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01644 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01644 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01644 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01644 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01644 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01644 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01644 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01644 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01644 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01644 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01644 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01644 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
P01644 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
P01644 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
P01644 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
P01644 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01644 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01644 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01644 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01644 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01644 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01644 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01644 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01644 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01644 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01644 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01644 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01644 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01644 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01644 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01644 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01644 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
P01644 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
P01644 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
P01644 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
P01644 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01644 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01644 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01644 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01644 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01644 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01644 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01644 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01644 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01644 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01644 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
P01644 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
P01644 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01644 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
P01644 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01644 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
P01644 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P01644 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
P01644 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P01644 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
P01644 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
P01644 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P01644 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01644 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01644 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01644 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01644 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01644 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P01644 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
P01644 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P01644 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P01644 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
P01644 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
P01644 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P01644 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P01644 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P01644 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P01644 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P01644 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
P01644 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
P01644 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
P01644 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P01644 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P01644 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01644 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01644 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01644 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
P01644 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.7 ms