Protein–RNA interactions for Protein: P01636

Ig kappa chain V-V region MOPC 149, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01636 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01636 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01636 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01636 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01636 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01636 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01636 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01636 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01636 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01636 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01636 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01636 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01636 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01636 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01636 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01636 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01636 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01636 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01636 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01636 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01636 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01636 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01636 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01636 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01636 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01636 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01636 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01636 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01636 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01636 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01636 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01636 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01636 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01636 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01636 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01636 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01636 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01636 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01636 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01636 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01636 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01636 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
P01636 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01636 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01636 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01636 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01636 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01636 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01636 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01636 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01636 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01636 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01636 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01636 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01636 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
P01636 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
P01636 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01636 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
P01636 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01636 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01636 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01636 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01636 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01636 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01636 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01636 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01636 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01636 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01636 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01636 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01636 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01636 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01636 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
P01636 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01636 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P01636 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01636 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01636 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01636 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01636 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01636 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01636 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01636 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01636 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01636 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01636 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01636 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
P01636 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01636 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01636 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01636 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01636 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01636 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01636 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01636 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01636 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01636 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01636 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01636 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01636 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms