Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifnb1P01575 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ifnb1P01575 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifnb1P01575 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ifnb1P01575 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ifnb1P01575 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ifnb1P01575 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ifnb1P01575 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ifnb1P01575 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ifnb1P01575 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ifnb1P01575 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ifnb1P01575 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ifnb1P01575 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ifnb1P01575 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ifnb1P01575 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ifnb1P01575 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifnb1P01575 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifnb1P01575 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifnb1P01575 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifnb1P01575 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms