Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mtatp6P00848 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Mtatp6P00848 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtatp6P00848 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms