Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccl20O89093 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccl20O89093 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl20O89093 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms