Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CpdO89001 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CpdO89001 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CpdO89001 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CpdO89001 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CpdO89001 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CpdO89001 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CpdO89001 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CpdO89001 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CpdO89001 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CpdO89001 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CpdO89001 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CpdO89001 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CpdO89001 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CpdO89001 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CpdO89001 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CpdO89001 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CpdO89001 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CpdO89001 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CpdO89001 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CpdO89001 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CpdO89001 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CpdO89001 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CpdO89001 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CpdO89001 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CpdO89001 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CpdO89001 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CpdO89001 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CpdO89001 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CpdO89001 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CpdO89001 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CpdO89001 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CpdO89001 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CpdO89001 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CpdO89001 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CpdO89001 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CpdO89001 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CpdO89001 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CpdO89001 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CpdO89001 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CpdO89001 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CpdO89001 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CpdO89001 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CpdO89001 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CpdO89001 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
CpdO89001 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CpdO89001 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CpdO89001 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CpdO89001 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CpdO89001 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CpdO89001 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CpdO89001 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CpdO89001 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CpdO89001 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CpdO89001 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CpdO89001 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CpdO89001 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CpdO89001 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CpdO89001 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CpdO89001 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CpdO89001 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CpdO89001 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CpdO89001 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CpdO89001 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CpdO89001 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CpdO89001 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CpdO89001 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CpdO89001 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CpdO89001 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CpdO89001 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CpdO89001 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CpdO89001 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CpdO89001 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CpdO89001 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CpdO89001 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CpdO89001 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CpdO89001 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CpdO89001 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CpdO89001 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CpdO89001 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CpdO89001 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CpdO89001 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CpdO89001 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CpdO89001 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CpdO89001 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CpdO89001 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CpdO89001 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CpdO89001 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CpdO89001 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CpdO89001 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CpdO89001 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CpdO89001 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CpdO89001 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CpdO89001 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CpdO89001 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CpdO89001 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CpdO89001 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CpdO89001 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CpdO89001 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CpdO89001 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms