Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F11rO88792 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F11rO88792 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
F11rO88792 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F11rO88792 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F11rO88792 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F11rO88792 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F11rO88792 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F11rO88792 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F11rO88792 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
F11rO88792 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F11rO88792 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
F11rO88792 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F11rO88792 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
F11rO88792 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F11rO88792 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F11rO88792 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F11rO88792 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F11rO88792 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F11rO88792 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F11rO88792 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
F11rO88792 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F11rO88792 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
F11rO88792 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F11rO88792 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
F11rO88792 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F11rO88792 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F11rO88792 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
F11rO88792 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F11rO88792 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F11rO88792 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F11rO88792 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
F11rO88792 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
F11rO88792 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F11rO88792 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F11rO88792 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F11rO88792 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F11rO88792 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
F11rO88792 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F11rO88792 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F11rO88792 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F11rO88792 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
F11rO88792 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F11rO88792 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F11rO88792 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
F11rO88792 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
F11rO88792 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F11rO88792 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F11rO88792 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
F11rO88792 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F11rO88792 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F11rO88792 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
F11rO88792 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
F11rO88792 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
F11rO88792 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F11rO88792 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F11rO88792 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
F11rO88792 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F11rO88792 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
F11rO88792 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F11rO88792 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F11rO88792 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F11rO88792 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
F11rO88792 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F11rO88792 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F11rO88792 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F11rO88792 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
F11rO88792 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
F11rO88792 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F11rO88792 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
F11rO88792 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F11rO88792 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F11rO88792 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F11rO88792 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F11rO88792 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
F11rO88792 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F11rO88792 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F11rO88792 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F11rO88792 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F11rO88792 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
F11rO88792 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
F11rO88792 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
F11rO88792 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
F11rO88792 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
F11rO88792 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F11rO88792 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
F11rO88792 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F11rO88792 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F11rO88792 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F11rO88792 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
F11rO88792 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
F11rO88792 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F11rO88792 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
F11rO88792 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
F11rO88792 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
F11rO88792 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
F11rO88792 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F11rO88792 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F11rO88792 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F11rO88792 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms