Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AurkcO88445 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
AurkcO88445 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
AurkcO88445 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AurkcO88445 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
AurkcO88445 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AurkcO88445 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AurkcO88445 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AurkcO88445 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AurkcO88445 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AurkcO88445 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AurkcO88445 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AurkcO88445 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AurkcO88445 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AurkcO88445 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
AurkcO88445 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AurkcO88445 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AurkcO88445 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AurkcO88445 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AurkcO88445 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms