Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nid2O88322 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nid2O88322 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nid2O88322 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nid2O88322 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nid2O88322 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nid2O88322 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Nid2O88322 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nid2O88322 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nid2O88322 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nid2O88322 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nid2O88322 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nid2O88322 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nid2O88322 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nid2O88322 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nid2O88322 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nid2O88322 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nid2O88322 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Nid2O88322 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nid2O88322 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nid2O88322 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nid2O88322 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nid2O88322 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nid2O88322 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nid2O88322 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nid2O88322 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nid2O88322 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nid2O88322 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Nid2O88322 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nid2O88322 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nid2O88322 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nid2O88322 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nid2O88322 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nid2O88322 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Nid2O88322 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nid2O88322 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nid2O88322 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Nid2O88322 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nid2O88322 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nid2O88322 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nid2O88322 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nid2O88322 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nid2O88322 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nid2O88322 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nid2O88322 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Nid2O88322 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Nid2O88322 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nid2O88322 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Nid2O88322 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nid2O88322 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nid2O88322 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nid2O88322 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Nid2O88322 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Nid2O88322 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Nid2O88322 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nid2O88322 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nid2O88322 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nid2O88322 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nid2O88322 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Nid2O88322 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nid2O88322 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nid2O88322 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nid2O88322 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nid2O88322 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nid2O88322 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nid2O88322 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nid2O88322 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nid2O88322 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nid2O88322 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nid2O88322 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nid2O88322 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nid2O88322 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nid2O88322 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nid2O88322 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nid2O88322 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nid2O88322 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nid2O88322 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nid2O88322 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nid2O88322 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nid2O88322 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nid2O88322 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nid2O88322 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nid2O88322 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nid2O88322 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nid2O88322 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nid2O88322 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nid2O88322 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nid2O88322 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nid2O88322 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nid2O88322 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nid2O88322 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Nid2O88322 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nid2O88322 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nid2O88322 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nid2O88322 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nid2O88322 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nid2O88322 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nid2O88322 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nid2O88322 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nid2O88322 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms