Protein–RNA interactions for Protein: O70218

Hmx1, Homeobox protein HMX1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx1O70218 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hmx1O70218 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hmx1O70218 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hmx1O70218 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hmx1O70218 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmx1O70218 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmx1O70218 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmx1O70218 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmx1O70218 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmx1O70218 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmx1O70218 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmx1O70218 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmx1O70218 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmx1O70218 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmx1O70218 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmx1O70218 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmx1O70218 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hmx1O70218 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hmx1O70218 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Hmx1O70218 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hmx1O70218 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmx1O70218 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmx1O70218 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmx1O70218 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmx1O70218 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmx1O70218 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmx1O70218 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmx1O70218 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmx1O70218 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmx1O70218 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms