Protein–RNA interactions for Protein: O55242

Sigmar1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, mousemouse

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sigmar1O55242 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sigmar1O55242 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sigmar1O55242 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sigmar1O55242 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sigmar1O55242 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sigmar1O55242 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sigmar1O55242 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sigmar1O55242 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sigmar1O55242 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sigmar1O55242 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sigmar1O55242 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sigmar1O55242 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sigmar1O55242 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sigmar1O55242 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sigmar1O55242 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sigmar1O55242 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sigmar1O55242 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sigmar1O55242 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sigmar1O55242 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sigmar1O55242 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sigmar1O55242 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sigmar1O55242 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sigmar1O55242 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sigmar1O55242 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sigmar1O55242 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sigmar1O55242 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sigmar1O55242 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sigmar1O55242 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sigmar1O55242 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sigmar1O55242 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sigmar1O55242 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Sigmar1O55242 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sigmar1O55242 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sigmar1O55242 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sigmar1O55242 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sigmar1O55242 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sigmar1O55242 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sigmar1O55242 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sigmar1O55242 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sigmar1O55242 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sigmar1O55242 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sigmar1O55242 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sigmar1O55242 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sigmar1O55242 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sigmar1O55242 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sigmar1O55242 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sigmar1O55242 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sigmar1O55242 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sigmar1O55242 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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