Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChkbO55229 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChkbO55229 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChkbO55229 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ChkbO55229 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChkbO55229 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChkbO55229 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChkbO55229 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ChkbO55229 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChkbO55229 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChkbO55229 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChkbO55229 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChkbO55229 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChkbO55229 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChkbO55229 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChkbO55229 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChkbO55229 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ChkbO55229 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ChkbO55229 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ChkbO55229 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChkbO55229 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ChkbO55229 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChkbO55229 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChkbO55229 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChkbO55229 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChkbO55229 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChkbO55229 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChkbO55229 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChkbO55229 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChkbO55229 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChkbO55229 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChkbO55229 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChkbO55229 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChkbO55229 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChkbO55229 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChkbO55229 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChkbO55229 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChkbO55229 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChkbO55229 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ChkbO55229 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChkbO55229 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ChkbO55229 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChkbO55229 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChkbO55229 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChkbO55229 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChkbO55229 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChkbO55229 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChkbO55229 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ChkbO55229 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChkbO55229 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChkbO55229 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChkbO55229 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChkbO55229 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ChkbO55229 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChkbO55229 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ChkbO55229 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChkbO55229 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ChkbO55229 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms