Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Eif6O55135 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Eif6O55135 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Eif6O55135 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Eif6O55135 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Eif6O55135 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Eif6O55135 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Eif6O55135 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Eif6O55135 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Eif6O55135 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Eif6O55135 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Eif6O55135 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Eif6O55135 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Eif6O55135 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Eif6O55135 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Eif6O55135 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Eif6O55135 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Eif6O55135 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Eif6O55135 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Eif6O55135 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Eif6O55135 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Eif6O55135 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Eif6O55135 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Eif6O55135 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Eif6O55135 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Eif6O55135 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Eif6O55135 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Eif6O55135 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Eif6O55135 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Eif6O55135 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Eif6O55135 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Eif6O55135 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Eif6O55135 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Eif6O55135 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Eif6O55135 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Eif6O55135 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Eif6O55135 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Eif6O55135 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Eif6O55135 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Eif6O55135 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Eif6O55135 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Eif6O55135 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Eif6O55135 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Eif6O55135 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Eif6O55135 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Eif6O55135 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Eif6O55135 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Eif6O55135 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Eif6O55135 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Eif6O55135 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Eif6O55135 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Eif6O55135 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Eif6O55135 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Eif6O55135 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Eif6O55135 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Eif6O55135 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Eif6O55135 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Eif6O55135 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Eif6O55135 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Eif6O55135 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Eif6O55135 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Eif6O55135 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Eif6O55135 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Eif6O55135 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Eif6O55135 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Eif6O55135 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Eif6O55135 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Eif6O55135 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Eif6O55135 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Eif6O55135 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Eif6O55135 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Eif6O55135 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Eif6O55135 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Eif6O55135 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Eif6O55135 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Eif6O55135 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Eif6O55135 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Eif6O55135 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Eif6O55135 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Eif6O55135 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Eif6O55135 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Eif6O55135 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Eif6O55135 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Eif6O55135 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Eif6O55135 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Eif6O55135 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Eif6O55135 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Eif6O55135 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Eif6O55135 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Eif6O55135 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Eif6O55135 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Eif6O55135 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Eif6O55135 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Eif6O55135 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Eif6O55135 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Eif6O55135 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Eif6O55135 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Eif6O55135 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Eif6O55135 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Eif6O55135 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms