Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cyp26a1O55127 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cyp26a1O55127 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cyp26a1O55127 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cyp26a1O55127 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cyp26a1O55127 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cyp26a1O55127 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cyp26a1O55127 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cyp26a1O55127 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cyp26a1O55127 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cyp26a1O55127 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cyp26a1O55127 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cyp26a1O55127 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cyp26a1O55127 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyp26a1O55127 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyp26a1O55127 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyp26a1O55127 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyp26a1O55127 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyp26a1O55127 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyp26a1O55127 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyp26a1O55127 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyp26a1O55127 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyp26a1O55127 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyp26a1O55127 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyp26a1O55127 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyp26a1O55127 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyp26a1O55127 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyp26a1O55127 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp26a1O55127 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp26a1O55127 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp26a1O55127 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cyp26a1O55127 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp26a1O55127 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms