Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mmp10O55123 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Mmp10O55123 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mmp10O55123 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mmp10O55123 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mmp10O55123 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mmp10O55123 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mmp10O55123 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mmp10O55123 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mmp10O55123 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mmp10O55123 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mmp10O55123 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mmp10O55123 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mmp10O55123 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mmp10O55123 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mmp10O55123 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mmp10O55123 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mmp10O55123 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mmp10O55123 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mmp10O55123 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mmp10O55123 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mmp10O55123 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mmp10O55123 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mmp10O55123 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mmp10O55123 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mmp10O55123 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Mmp10O55123 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mmp10O55123 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mmp10O55123 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms