Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2f6O54917 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2f6O54917 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2f6O54917 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2f6O54917 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
E2f6O54917 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2f6O54917 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2f6O54917 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2f6O54917 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2f6O54917 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2f6O54917 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
E2f6O54917 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
E2f6O54917 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
E2f6O54917 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E2f6O54917 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E2f6O54917 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2f6O54917 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2f6O54917 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
E2f6O54917 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E2f6O54917 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2f6O54917 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
E2f6O54917 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E2f6O54917 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2f6O54917 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2f6O54917 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2f6O54917 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2f6O54917 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2f6O54917 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2f6O54917 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2f6O54917 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2f6O54917 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2f6O54917 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2f6O54917 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms