Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EdaO54693 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EdaO54693 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EdaO54693 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EdaO54693 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EdaO54693 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EdaO54693 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EdaO54693 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EdaO54693 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EdaO54693 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EdaO54693 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EdaO54693 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EdaO54693 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EdaO54693 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EdaO54693 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EdaO54693 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EdaO54693 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EdaO54693 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EdaO54693 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EdaO54693 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EdaO54693 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EdaO54693 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EdaO54693 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EdaO54693 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EdaO54693 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EdaO54693 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EdaO54693 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EdaO54693 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EdaO54693 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EdaO54693 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EdaO54693 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EdaO54693 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EdaO54693 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EdaO54693 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EdaO54693 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EdaO54693 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EdaO54693 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EdaO54693 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EdaO54693 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EdaO54693 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EdaO54693 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EdaO54693 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EdaO54693 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EdaO54693 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EdaO54693 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EdaO54693 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EdaO54693 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EdaO54693 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EdaO54693 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EdaO54693 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EdaO54693 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EdaO54693 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EdaO54693 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EdaO54693 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EdaO54693 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EdaO54693 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EdaO54693 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EdaO54693 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EdaO54693 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EdaO54693 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EdaO54693 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EdaO54693 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EdaO54693 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EdaO54693 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EdaO54693 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EdaO54693 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EdaO54693 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EdaO54693 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EdaO54693 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EdaO54693 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EdaO54693 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EdaO54693 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EdaO54693 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EdaO54693 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EdaO54693 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EdaO54693 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EdaO54693 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EdaO54693 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EdaO54693 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EdaO54693 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EdaO54693 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EdaO54693 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EdaO54693 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EdaO54693 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EdaO54693 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EdaO54693 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EdaO54693 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EdaO54693 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EdaO54693 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EdaO54693 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EdaO54693 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EdaO54693 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EdaO54693 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EdaO54693 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EdaO54693 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EdaO54693 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EdaO54693 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EdaO54693 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
EdaO54693 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EdaO54693 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms