Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sp100O35892 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sp100O35892 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sp100O35892 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sp100O35892 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sp100O35892 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sp100O35892 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sp100O35892 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sp100O35892 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sp100O35892 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sp100O35892 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sp100O35892 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sp100O35892 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sp100O35892 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sp100O35892 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sp100O35892 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sp100O35892 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sp100O35892 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sp100O35892 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sp100O35892 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sp100O35892 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sp100O35892 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sp100O35892 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sp100O35892 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sp100O35892 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sp100O35892 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sp100O35892 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sp100O35892 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sp100O35892 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sp100O35892 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sp100O35892 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sp100O35892 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sp100O35892 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sp100O35892 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sp100O35892 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sp100O35892 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sp100O35892 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sp100O35892 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sp100O35892 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sp100O35892 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sp100O35892 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sp100O35892 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sp100O35892 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sp100O35892 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sp100O35892 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sp100O35892 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sp100O35892 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sp100O35892 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sp100O35892 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sp100O35892 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sp100O35892 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sp100O35892 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sp100O35892 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sp100O35892 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sp100O35892 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sp100O35892 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sp100O35892 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sp100O35892 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sp100O35892 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sp100O35892 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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