Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NudcO35685 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NudcO35685 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NudcO35685 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NudcO35685 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NudcO35685 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NudcO35685 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NudcO35685 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NudcO35685 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NudcO35685 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NudcO35685 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NudcO35685 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NudcO35685 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NudcO35685 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NudcO35685 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NudcO35685 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NudcO35685 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NudcO35685 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NudcO35685 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NudcO35685 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NudcO35685 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NudcO35685 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NudcO35685 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NudcO35685 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NudcO35685 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NudcO35685 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NudcO35685 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NudcO35685 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NudcO35685 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NudcO35685 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NudcO35685 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NudcO35685 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NudcO35685 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NudcO35685 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NudcO35685 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NudcO35685 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NudcO35685 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NudcO35685 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NudcO35685 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NudcO35685 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NudcO35685 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NudcO35685 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NudcO35685 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NudcO35685 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NudcO35685 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NudcO35685 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NudcO35685 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NudcO35685 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NudcO35685 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NudcO35685 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NudcO35685 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NudcO35685 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NudcO35685 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NudcO35685 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NudcO35685 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NudcO35685 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NudcO35685 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NudcO35685 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NudcO35685 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NudcO35685 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NudcO35685 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NudcO35685 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NudcO35685 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NudcO35685 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NudcO35685 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NudcO35685 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NudcO35685 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NudcO35685 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NudcO35685 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NudcO35685 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NudcO35685 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NudcO35685 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NudcO35685 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NudcO35685 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NudcO35685 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NudcO35685 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NudcO35685 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NudcO35685 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NudcO35685 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NudcO35685 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NudcO35685 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NudcO35685 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NudcO35685 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NudcO35685 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NudcO35685 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NudcO35685 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NudcO35685 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NudcO35685 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NudcO35685 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NudcO35685 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NudcO35685 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NudcO35685 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NudcO35685 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NudcO35685 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NudcO35685 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NudcO35685 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NudcO35685 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NudcO35685 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NudcO35685 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NudcO35685 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms