Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RaxO35602 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RaxO35602 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RaxO35602 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RaxO35602 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RaxO35602 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RaxO35602 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RaxO35602 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RaxO35602 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RaxO35602 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RaxO35602 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RaxO35602 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RaxO35602 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RaxO35602 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RaxO35602 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RaxO35602 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RaxO35602 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RaxO35602 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RaxO35602 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RaxO35602 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RaxO35602 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RaxO35602 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RaxO35602 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RaxO35602 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RaxO35602 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RaxO35602 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RaxO35602 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RaxO35602 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RaxO35602 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RaxO35602 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RaxO35602 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RaxO35602 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RaxO35602 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RaxO35602 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RaxO35602 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RaxO35602 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RaxO35602 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RaxO35602 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RaxO35602 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RaxO35602 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RaxO35602 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RaxO35602 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RaxO35602 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RaxO35602 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RaxO35602 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RaxO35602 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RaxO35602 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RaxO35602 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RaxO35602 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RaxO35602 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RaxO35602 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RaxO35602 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RaxO35602 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RaxO35602 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RaxO35602 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RaxO35602 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RaxO35602 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RaxO35602 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RaxO35602 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RaxO35602 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RaxO35602 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RaxO35602 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RaxO35602 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RaxO35602 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RaxO35602 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RaxO35602 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RaxO35602 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RaxO35602 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RaxO35602 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RaxO35602 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RaxO35602 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RaxO35602 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RaxO35602 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RaxO35602 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RaxO35602 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RaxO35602 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RaxO35602 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RaxO35602 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RaxO35602 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RaxO35602 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RaxO35602 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RaxO35602 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RaxO35602 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RaxO35602 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RaxO35602 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RaxO35602 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RaxO35602 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RaxO35602 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RaxO35602 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RaxO35602 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RaxO35602 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RaxO35602 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RaxO35602 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RaxO35602 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RaxO35602 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RaxO35602 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RaxO35602 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RaxO35602 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RaxO35602 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RaxO35602 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms