Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrt1O35449 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrt1O35449 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrt1O35449 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrt1O35449 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrt1O35449 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrt1O35449 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrt1O35449 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrt1O35449 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrt1O35449 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrt1O35449 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrt1O35449 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrt1O35449 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrt1O35449 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrt1O35449 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrt1O35449 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrt1O35449 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrt1O35449 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrt1O35449 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrt1O35449 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrt1O35449 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrt1O35449 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrt1O35449 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms