Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnf5O35445 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf5O35445 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf5O35445 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf5O35445 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf5O35445 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf5O35445 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf5O35445 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf5O35445 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf5O35445 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf5O35445 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf5O35445 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf5O35445 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf5O35445 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf5O35445 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf5O35445 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf5O35445 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf5O35445 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf5O35445 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf5O35445 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf5O35445 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms